一文读懂医疗数据标注全流程
从智能影像诊断到药物研发加速,从个性化治疗方案到流行病预测,都隐藏着一个至关重要的基础环节——医疗数据标注。通过为原始医疗数据添加准确的标签,医疗数据标注教会 AI 理解和处理复杂的医疗信息。
01、数据采集与脱敏:合规与质量的起点
医疗数据来源广泛,主要包括电子病历系统中的患者病历信息,涵盖症状、诊断结果、治疗方案等;医学影像设备产生的 X 光片、CT 扫描、MRI 影像等;以及医学研究文献、临床试验数据等。
为了确保数据的质量和多样性,收集数据时要兼顾不同地区、不同年龄段、不同病情严重程度的患者数据。例如,在收集肺癌相关数据时,既要有早期肺癌患者的资料,也要有中晚期患者的信息;既要包含大城市医院的数据,也要纳入基层医疗机构的数据。
此外,要对原始数据进行严格的去标识化处理,移除或加密患者姓名、身份证号、联系方式等直接标识符,并对可能推断出患者身份的信息(如罕见病、特定地域、小群体数据)进行泛化处理。
02、数据预处理:去粗取精,规范格式
原始的医疗数据往往存在噪声和不规范的情况,因此需要进行预处理。这一步骤主要包括数据清洗和数据转换。数据清洗就是去除数据中的重复内容、无关的特殊符号、错误信息等。比如,电子病历中可能存在错别字、格式混乱的日期等,都需要进行修正。数据转换则是将数据统一为适合标注和模型训练的格式,如将不同分辨率的医学影像调整为相同分辨率,将文本数据中的医学术语统一为标准表述。
03、标注准备:制定规则,培训人员
在正式标注之前,制定详细的标注指南至关重要。首先需要明确各类医疗实体的定义和标注规则,如疾病名称、药物名称、症状等的标注规范。以疾病名称标注为例,要规定如何准确识别和标注疾病的全称、简称以及别名。同时,对标注人员进行专业培训,确保他们熟悉标注指南和标注工具的使用。培训内容不仅包括理论知识讲解,还应有实际案例演练和答疑环节,让标注人员充分理解标注要求。
04、标注执行:精准标注
医疗数据标注形式多样,常见的有文本标注、图像标注和视频标注。
文本标注:针对医学文献、病历文本等,标注人员需提取其中的关键信息,如症状(“咳嗽”“发热”)、疾病(“糖尿病”“高血压”)、药物(“阿司匹林”“青霉素”)等实体,并标注其类别。通常采用 BIO 标注法,即 “Begin”(实体的起始位置)、“Inside”(实体的内部位置)和 “Outside”(非实体部分)来标记文本中的实体。
图像标注:在医学影像标注中,标注人员要识别并标记影像中的解剖结构、病变部位等。比如,在肺部 X 光片标注中,需圈出肺部的轮廓、标注出可能存在的结节或阴影位置。常用的标注方式有边界框标注(用于标记物体的大致范围)、语义分割(对每个像素进行分类,精确标注病变区域)等。
视频标注:对于手术视频、患者监测视频等,标注人员需跟踪视频中的关键对象和事件,如手术器械的使用、手术步骤的进展、患者的异常行为等。例如,在心脏搭桥手术视频标注中,要标注出每一个关键手术步骤的开始和结束时间点。
05、质量审核:贯穿始终的生命线
医疗数据标注容不得丝毫马虎,质量审核是保证标注数据质量的关键环节。一般采用交叉审核,抽样检查以及专家审核相结合的方式。
交叉审核即安排不同的标注人员对同一批数据进行标注,然后对比他们的标注结果,找出差异并进行讨论修正。
抽样检查则是从标注好的数据中抽取一定比例的样本,由经验丰富的审核人员或医学专家进行细致审核,计算错误率,若错误率超过设定的阈值(如 5%),则需要对整批数据进行重新审核或修正。
专家审核则是 临床专家定期抽查(尤其针对关键、疑难样本),确保医学准确性。
最后还需要进行反馈闭环,所有质控发现的问题必须及时反馈给标注员,进行修正、复盘,并用于更新标注指南和强化培训。
06、数据存储与应用:妥善保存,发挥价值
经过审核的标注数据,要以合适的格式(如 XML、JSON 等)存储在安全可靠的数据库中,以便后续检索和使用。
这些标注数据可用于训练各种医疗 AI 模型,如疾病诊断模型、医学影像识别模型、药物研发模型等。例如,通过大量标注好的医学影像数据训练的 AI 模型,能够快速、准确地识别出影像中的疾病特征,辅助医生进行疾病诊断;在药物研发中,利用标注后的临床试验数据训练的模型,可帮助筛选潜在的药物靶点,加速药物研发进程。
医疗数据标注全流程是一个严谨且复杂的过程,每一个环节都紧密相连,缺一不可。高质量的医疗数据标注为医疗 AI 的发展提供了坚实的数据基础,推动着医疗行业向智能化、精准化方向大步迈进。淘丁医疗数据标注团队凭借其专业的团队构成、严格的质量把控体系和卓越的数据安全保障能力,成为医疗数据标注领域值得信赖的合作伙伴。如果有医疗标注相关需求,欢迎咨询~
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