医疗数据中的数据清洗与预处理方法

来源:淘丁集团

在医疗AI领域,我们常听到炫目的算法和突破性的模型,但很少有人关注那些在幕后默默支撑整个系统的基础工作——数据清洗与预处理。事实上,医疗数据的质量直接决定了智能医疗系统的上限。

01为什么医疗数据需要特别处理?

医疗数据来源广泛,涵盖医院信息系统、影像设备、可穿戴设备以及临床研究数据库等。不同来源的数据格式、标准和质量参差不齐。电子病历中的数据可能存在记录不完整、格式混乱的情况;医疗设备采集的数据可能受到噪声干扰,出现异常值;多源数据在整合时,由于编码系统不一致,导致数据难以匹配和融合。

数据缺失在医疗数据中较为常见。患者可能拒绝提供某些敏感信息,如家族病史;数据采集过程中,设备故障、网络问题等也可能导致部分数据丢失。

噪声可能由设备精度问题、数据传输干扰等引起,使得数据偏离真实值。异常值则可能是由于患者的特殊生理状况、测量错误或数据录入失误导致。在血压监测数据中,偶尔出现的极不正常的高值或低值,若不加以处理,会对整体数据分析结果产生误导。

因为医疗数据具有专业性强、高度敏感、数据来源广泛等特点,因此医疗数据的清洗与预处理成为一项必不可少的工作。

02医疗数据清洗的关键步骤

1、缺失值处理

医疗记录中缺失值普遍存在,处理方法需要格外谨慎:

(1)使用多重插补(Multiple Imputation)技术

(2)基于链式方程的插补(MICE)方法

(3)针对临床指标,结合医学知识进行合理插补

切忌不要直接删除含有缺失值的记录,这可能导致严重的选择偏倚。

2、异常值检测与处理

医疗数据中的异常值可能是测量错误,也可能是真实的危急值:(1)删除:对于确认为错误或对分析结果有严重干扰的异常值,可直接删除。在设备故障导致某段时间内的血压监测数据出现明显错误时,删除该时段的数据可避免对整体分析的影响。但需谨慎使用,以免丢失有价值的信息,特别是在样本量较小的情况下。(2)修正:若能确定异常值的产生原因,可对其进行修正。如果是数据录入错误导致的异常值,可通过核对原始记录进行纠正。对于因测量误差产生的异常值,可根据合理的范围或参考其他相关数据进行调整。(3)变换:对包含异常值的数据进行变换,如对数变换、平方根变换等,可减小异常值对分析结果的影响。在分析具有长尾分布的医疗费用数据时,对数变换可使数据分布更加均匀,降低异常高值的影响。

3、标准化与归一化

不同来源的数据需要统一标准:

(1)实验室指标单位统一

(2)时间格式标准化

(3)医学术语标准化

医疗数据清洗与预处理是医疗大数据应用的基石,只有经过精心处理的数据,才能训练出真正可信、可用的医疗AI模型,最终为患者提供安全有效的智能医疗服务。

正如一句行业老话所说:“垃圾进,垃圾出。”在医疗领域,这句话可能意味着生与死的差别。重视数据清洗与预处理,就是对生命负责的表现。

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